En la final llegó una revancha contra Boca luego de la final perdida de 1989. Los xeneizes empezaron ganando en la Bombonera, pero dos goles de Sebastián Rambert, uno para sellar el empate, y otro para triunfar en el partido de vuelta, le alcanzaron para levantar la copa por primera vez. Morales entró en la segunda mitad de un partido que el Villarreal tenía encarrilado y el jugador madrileño se encargó de ponerle su firma personal.
